关于探究的蛋白质相互作用的数据库,之前介绍过STRING就是这样的数据库,为什么很多生信的文章都是使用STRING来探讨基因之间的相互作用关系,主要原因还是STRING支持输入多个基因,寻找多个基因之间的相关作用关系。但是如果我们只有一个基因的话,想要知道这个基因和其他什么基因有关系的话,这个时候,STRING虽然也能做,但是预测的结果和结果的多样性就没有另外一个数据库好了。这个数据库就是 BioGRID (https://thebiogrid.org/ , 点击阅读原文可直达数据库)。
打开链接,官网界面如下,使用起来非常简单,在搜索框输入基因名称、选择物种、提交, 3步即可得出结果。
1. 该基因的基本信息,如:别称、GO、转录后修饰情况等,并提供外源数据库链接。
2. 基因间的相互作用方式、具体检测方式及其所占百分比。
3. 基因相互作用的详细信息及下载。